在2009年夏季,C罗离开曼联加盟皇马后,鲁尼变成了曼联唯一的核心,2009-2010赛季英超刚一开赛,鲁尼的进攻欲望就愈发强大,英超前六轮便打进6球,整个赛季下来各项赛事打进了34球,率领球队夺得了2009-2010的联赛杯冠军。
在2012-2013赛季曼联引进了超级射手范佩西,原本曼联计划是让范佩西和鲁尼组成双核的攻击线,但范佩西的出色表现迅速占据了核心的地位,这反而让鲁尼在很多重要的比赛中得不到首发的机会,虽然最后曼联获得了联赛冠军,但鲁尼却向曼联提出了转会申请,狂人穆里尼奥更是多次公开表达了对鲁尼的喜爱,不过由于曼联新帅莫耶斯是鲁尼的恩师,并且坚决要求曼联留下鲁尼,因此鲁尼也放下了转会的念头。
但随着弗格森的退休,红魔曼联仿佛失去了魔力,虽然每个赛季都有大手笔的引援,但是总是不能取得理想的成绩,鲁尼的表现也逐年下滑,直到穆里尼奥的接手,让曼联重获新生,2016-2017赛季曼联收获了联赛杯和欧联杯的冠军,但是鲁尼在联赛杯决赛一分钟没上,欧联杯决赛也是在伤停补时才替补登场,现在的鲁尼已经不再是曼联不可或缺的球员,赛季之中他甚至和中超传出过绯闻,种种一切现象都表现出鲁尼在曼联的辉煌时代即将成为历史。
鲁尼在为红魔效力的13年期间,为红魔出场559次,打进了253个进球。他为球队赢得了5座英超冠军、1座足总杯冠军、4座联赛杯冠军、4座社区盾杯冠军、1次欧冠冠军、1次欧联冠军和1次世俱杯冠军。在2016-2017赛季里,鲁尼打进了在曼联生涯的第253球,成功超越了传奇前锋博比-查尔顿爵士,成为了曼联队史第一射手。
2017年7月9日,鲁尼从曼联正式转会加盟英超埃弗顿足球俱乐部。2018年6月28日,英超埃弗顿官方宣布,球队与美国足球职业大联盟的华盛顿特区联足球俱乐部就鲁尼的转会达成一致。鲁尼加盟华盛顿联队,随着转会大联盟,鲁尼16年的英超生涯也宣告终结。2019年11月29日,英格兰冠军联赛球队德比郡队官方宣布,前英格兰与曼联双料队长鲁尼以球员兼教练的身份加盟球队。